MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT7

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020243	A	6	6	98	103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020243	ACA	2	6	113	118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020243	T	7	7	142	148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020243	CA	3	6	151	156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020243	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	449086548
6	NC_020243	TA	3	6	254	259	50 %	50 %	0 %	0 %	449086548
7	NC_020243	TAAA	2	8	352	359	75 %	25 %	0 %	0 %	449086548
8	NC_020243	A	6	6	413	418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020243	A	6	6	423	428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020243	GATATA	2	12	445	456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020243	A	7	7	460	466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020243	AGT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020243	ATC	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020243	AT	3	6	528	533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020243	AAAT	2	8	551	558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020243	AAATTT	2	12	571	582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020243	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020243	T	6	6	595	600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020243	TGC	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020243	TTTC	2	8	660	667	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020243	A	6	6	673	678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020243	GA	3	6	679	684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020243	TC	3	6	709	714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020243	ATC	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020243	CAC	2	6	740	745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_020243	TTC	2	6	834	839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086549
27	NC_020243	T	6	6	879	884	0 %	100 %	0 %	0 %	449086549
28	NC_020243	TCA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086550
29	NC_020243	TAA	2	6	1014	1019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086550
30	NC_020243	T	6	6	1070	1075	0 %	100 %	0 %	0 %	449086550
31	NC_020243	AATT	2	8	1106	1113	50 %	50 %	0 %	0 %	449086550
32	NC_020243	TAAA	2	8	1130	1137	75 %	25 %	0 %	0 %	449086550
33	NC_020243	TTC	2	6	1298	1303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086550
34	NC_020243	T	7	7	1338	1344	0 %	100 %	0 %	0 %	449086550
35	NC_020243	ATA	2	6	1427	1432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086550
36	NC_020243	TGT	2	6	1447	1452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086550
37	NC_020243	TGA	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086550
38	NC_020243	AAT	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086550
39	NC_020243	TTA	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086550
40	NC_020243	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086550
41	NC_020243	AAGAA	2	10	1629	1638	80 %	0 %	20 %	0 %	449086550
42	NC_020243	CTTT	2	8	1642	1649	0 %	75 %	0 %	25 %	449086550
43	NC_020243	CAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086550
44	NC_020243	TTTCTT	2	12	1763	1774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	449086550
45	NC_020243	TC	3	6	1827	1832	0 %	50 %	0 %	50 %	449086550
46	NC_020243	CTCA	2	8	1838	1845	25 %	25 %	0 %	50 %	449086550
47	NC_020243	TCT	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086550
48	NC_020243	AT	3	6	1942	1947	50 %	50 %	0 %	0 %	449086550
49	NC_020243	A	6	6	1968	1973	100 %	0 %	0 %	0 %	449086550
50	NC_020243	TCCT	2	8	2003	2010	0 %	50 %	0 %	50 %	449086550
51	NC_020243	CCG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449086550
52	NC_020243	T	8	8	2075	2082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020243	AAAG	2	8	2159	2166	75 %	0 %	25 %	0 %	449086551
54	NC_020243	A	7	7	2201	2207	100 %	0 %	0 %	0 %	449086551
55	NC_020243	T	6	6	2239	2244	0 %	100 %	0 %	0 %	449086551
56	NC_020243	ATT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086551
57	NC_020243	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	449086551
58	NC_020243	AAC	2	6	2309	2314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086551
59	NC_020243	AT	3	6	2368	2373	50 %	50 %	0 %	0 %	449086551
60	NC_020243	A	6	6	2402	2407	100 %	0 %	0 %	0 %	449086551
61	NC_020243	CTTT	2	8	2464	2471	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020243	TAAA	2	8	2475	2482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020243	CAAG	2	8	2490	2497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020243	CTAA	2	8	2607	2614	50 %	25 %	0 %	25 %	449086552
65	NC_020243	ATA	3	9	2620	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086552
66	NC_020243	ACA	2	6	2643	2648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086552
67	NC_020243	AAG	2	6	2665	2670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086552
68	NC_020243	A	6	6	2675	2680	100 %	0 %	0 %	0 %	449086552
69	NC_020243	CAAA	3	12	2688	2699	75 %	0 %	0 %	25 %	449086552
70	NC_020243	TA	3	6	2718	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	449086552
71	NC_020243	A	6	6	2770	2775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020243	AGG	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020243	A	6	6	2838	2843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020243	ACT	2	6	2906	2911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020243	GAA	2	6	2954	2959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020243	A	7	7	2977	2983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020243	A	7	7	2987	2993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020243	GGA	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020243	TA	3	6	3138	3143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020243	TTA	2	6	3228	3233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020243	CAA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020243	ATT	2	6	3311	3316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020243	CAAA	2	8	3352	3359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020243	GTA	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020243	GAA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020243	TCA	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020243	T	6	6	3557	3562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020243	AAAC	2	8	3566	3573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020243	TAT	2	6	3615	3620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020243	A	6	6	3656	3661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020243	CA	3	6	3668	3673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020243	CCT	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020243	ATT	2	6	3691	3696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086553
94	NC_020243	ACA	2	6	3720	3725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086553
95	NC_020243	TCAT	2	8	3729	3736	25 %	50 %	0 %	25 %	449086553
96	NC_020243	TCAT	2	8	3792	3799	25 %	50 %	0 %	25 %	449086553
97	NC_020243	ATC	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086553
98	NC_020243	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086553
99	NC_020243	GTT	2	6	3979	3984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020243	AAT	2	6	3990	3995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020243	TC	3	6	4008	4013	0 %	50 %	0 %	50 %	449086554
102	NC_020243	CTT	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086554
103	NC_020243	TGT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086554
104	NC_020243	TTGT	2	8	4086	4093	0 %	75 %	25 %	0 %	449086554
105	NC_020243	TCA	3	9	4123	4131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086554
106	NC_020243	CTTC	2	8	4277	4284	0 %	50 %	0 %	50 %	449086554
107	NC_020243	TC	3	6	4295	4300	0 %	50 %	0 %	50 %	449086554
108	NC_020243	A	6	6	4327	4332	100 %	0 %	0 %	0 %	449086554
109	NC_020243	TA	3	6	4343	4348	50 %	50 %	0 %	0 %	449086554
110	NC_020243	ATC	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086554
111	NC_020243	AATCTT	2	12	4368	4379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086554
112	NC_020243	AGA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086554
113	NC_020243	TCT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086554
114	NC_020243	GAC	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086554
115	NC_020243	TTTC	2	8	4574	4581	0 %	75 %	0 %	25 %	449086554
116	NC_020243	TTG	2	6	4608	4613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086554
117	NC_020243	A	6	6	4749	4754	100 %	0 %	0 %	0 %	449086554
118	NC_020243	GTTTTT	2	12	4769	4780	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	449086554
119	NC_020243	T	6	6	4817	4822	0 %	100 %	0 %	0 %	449086554
120	NC_020243	TTCTC	2	10	4852	4861	0 %	60 %	0 %	40 %	449086554
121	NC_020243	A	6	6	4876	4881	100 %	0 %	0 %	0 %	449086554
122	NC_020243	AAC	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086554
123	NC_020243	ACA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086554
124	NC_020243	ACA	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086554
125	NC_020243	TGAA	2	8	5029	5036	50 %	25 %	25 %	0 %	449086554
126	NC_020243	CTTTT	2	10	5051	5060	0 %	80 %	0 %	20 %	449086554
127	NC_020243	CGTT	2	8	5088	5095	0 %	50 %	25 %	25 %	449086554
128	NC_020243	AAT	2	6	5100	5105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086554
129	NC_020243	CTTT	2	8	5122	5129	0 %	75 %	0 %	25 %	449086554
130	NC_020243	CTT	2	6	5222	5227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086554
131	NC_020243	CCG	2	6	5306	5311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_020243	GAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020243	CAT	2	6	5511	5516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020243	TCCG	2	8	5533	5540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020243	CTC	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020243	AT	3	6	5595	5600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020243	ACT	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086555
138	NC_020243	T	7	7	5685	5691	0 %	100 %	0 %	0 %	449086555
139	NC_020243	ATTC	2	8	5816	5823	25 %	50 %	0 %	25 %	449086555
140	NC_020243	A	6	6	5840	5845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020243	GTG	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020243	GTAT	2	8	5980	5987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020243	A	7	7	6020	6026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020243	T	6	6	6048	6053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020243	TCA	2	6	6060	6065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_020243	CCA	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_020243	CA	3	6	6100	6105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020243	AACA	2	8	6206	6213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020243	AGAA	2	8	6219	6226	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020243	TCA	2	6	6333	6338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_020243	ATT	2	6	6373	6378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020243	AT	3	6	6399	6404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020243	TAC	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020243	T	6	6	6601	6606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020243	T	6	6	6637	6642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020243	GTT	2	6	6672	6677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020243	T	6	6	6676	6681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020243	A	6	6	6738	6743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020243	TTAAA	2	10	6772	6781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020243	TA	3	6	6789	6794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020243	TTAT	2	8	6804	6811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020243	TTTA	3	12	6812	6823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020243	TTAAA	2	10	6842	6851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020243	ATT	2	6	6867	6872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020243	TTG	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_020243	AT	3	6	6964	6969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020243	A	7	7	6976	6982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_020243	A	6	6	7083	7088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020243	AGAA	2	8	7096	7103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020243	AAC	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_020243	ACT	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_020243	A	6	6	7200	7205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020243	ACT	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_020243	TAAC	2	8	7224	7231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_020243	A	6	6	7326	7331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020243	CAAA	2	8	7343	7350	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
177	NC_020243	TATT	2	8	7358	7365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_020243	TAA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_020243	GA	3	6	7481	7486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
180	NC_020243	TAAA	2	8	7521	7528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_020243	A	6	6	7536	7541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020243	TCA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_020243	T	6	6	7562	7567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_020243	T	6	6	7583	7588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_020243	CAT	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_020243	TAA	2	6	7612	7617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_020243	TA	3	6	7624	7629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.